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系统评价/Meta分析理论与实践 /罗杰 冷卫东
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商家编码:B00CHWORKI
ISBN编号:6
副书名:系统评价/Meta分析理论与实践 /罗杰 冷卫东
开始时间: 17:55
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保修:无保修
书名:系统评价/Meta分析理论与实践
原价:80.00元
作者:罗杰 冷卫东
出版社:军事医学科学出版社
出版日期:日
版次:第1版
商品标识:asinB00CHWORKI
《系统评价/Meta分析理论与实践》图文并茂,案例翔实,是一本针对性强的参考书。
第一篇基础篇 第一章系统评价/Meta分析概述 第一节历史与现状 第二节概念及特点 第二章系统评价/Meta分析报告规范与制作步骤 第一节历史与发展 第二节报告规范 第三节制作步骤 第三章原始研究类型及报告规范 第一节分类的基点 第二节随机对照试验 第三节非随机实验性研究 第四节观察性研究 第五节筛查/诊断性研究 第六节动物实验 第四章系统评价/Meta分析常用中英文数据库简介 第一节原始研究检索基础 第二节检索步骤及策略 第三节原始研究的获取 第四节几个常用的数据库介绍 第五节检索策略报告规范 第五章原始研究的质量评价工具 第一节研究设计的相关术语 第二节质量评价的相关概念 第三节随机对照试验的质量评价工具 第四节观察性研究的质量评价工具 第五节非随机实验性研究的质量评价工具 第六节诊断性研究及动物实验的质量评价工具 第六章资料提取 第一节资料来源 第二节资料提取的原则及步骤 第三节资料提取表的设计 第四节数据的转换 第七章Meta分析常用统计学指标及方法 第一节相关概念 第二节计数资料的效应量 第三节计量资料的效应量 第四节Meta分析方法及模型 第八章Meta分析中的异质性 第一节异质性的含义及类型 第二节异质性的识别 第三节异质性的处理 第九章系统评价/Meta分析中的偏倚 第一节偏倚的含义及类型 第二节报告偏倚的评价 第十章诊断准确性试验及Meta分析的统计学基础 第一节诊断试验研究的基本要点 第二节诊断试验的评价指标 第三节诊断试验的ROC曲线分析 第四节诊断试验的Meta分析统计基础 第十一章系统评价/Meta分析相关图形的解读 第一节概述 第二节图形解读 第十二章GRADE系统 第一节背景 第二节GRADE系统特点 第三节GRADE证据质量分级的定量标准 第十三章系统评价/Meta分析的质量评价工具 第一节AMSTAR量表 第二节OQAQ量表 第三节CASP清单 第四节SQAC量表 第五节各种报告规范 第二篇软件篇 第十四章Stata在Meta分析中的应用 第一节Stata简介 第二节Stata基本操作 第三节Stata进行Meta分析的基础 第四节Stata行二分类数据Meta分析 第五节Stata行连续型资料的Meta分析 第六节Stata在分析发表偏倚中的应用 第七节Stata在异质性分析中的作用 第八节Stata实现累积Meta分析及敏感性分析 第九节Stata在诊断性试验Meta分析中的应用 第十五章R语言在Meta分析中的应用 第一节R语言简介及基本操作 第二节Metafor程序包在Meta分析中的应用 第三节Meta程序包在Meta分析中的应用 第十六章RevMarl在Meta分析中的应用 第一节简介及基本操作 第二节二分类数据的Meta分析 第三节参数设置及图形保存 第四节连续型变量的Meta分析 第五节亚组分析 第六节诊断性试验的Meta分析 第七节诊断性试验Meta分析的功能拓展 第八节评价 第十七章Meta―Disc在Meta分析中的应用 第一节概述 第二节主要功能 第三节Meta―Disc行诊断I生试验Meta分析 第十八章CompreherlsiveMeta―Analysis在Meta分析中的应用 第一节概述 第二节技术参数 第三节操作流程 第四节检测发表偏倚 第五节其他分析 第六节其他功能 第七节Meta回归分析 第十九章WirlBtJGS在贝叶斯Meta分析中的应用 第一节Bayes统计简介 第二节WinBUGS简介 第三节贝叶斯Mcta分析 第二十章Meta―Analyst在Meta分析中的应用 第一节简介与操作 第二节二分类数据的Meta分析 第三节连续型数据的Meta分析 第四节诊断性试验的Meta分析 第五节累积Meta分析 第六节敏感性分析 第七节Meta回归分析 第八节亚组分析 第九节其他功能 第二十一章EndNote在文献管理中的应用 第一节EndNote简介 第二节数据管理 第三节使用EN撰写论文 第四节小结 第二十二章NoteExpress在文献管理中的应用 第一节概述 第二节NE的主要功能及操作 第二十三章GRADEprofiler在证据评级中的应用 第一节GRADEprofiler简介 第二节GRADEpro的功能 第三节GRADEpro的使用 第四节GRADEpro与RevMan的相互导入 第五节评价 第三篇实战篇 第二十四章临床随机对照试验直接证据的系统评价/Meta分析 第一节无Meta分析的系统评价 第二节单纯的Meta分析 第二十五章诊断性准确性试验的系统评价/Meta分析 第一节首次Meta分析 第二节Cochrane系统评价:聚焦于特定群体 第三节相同主题:聚焦于特定方法 第四节相同主题:更新Meta分析 第五节相同主题:聚焦特定种族 第二十六章队列研究的Meta分析 第一节首次Meta分析 第二节更新Meta分析 第三节合并RR及其95%CI在软件中的实现 第二十七章病例一对照研究的Meta分析 第一节Meta分析相关问题 第二节案例剖析 第三节软件实现 第二十八章横断面研究的Meta分析 第一节相关概念 第二节实例剖析 第三节软件实现 第二十九章动物实验的系统评价/Meta分析 第一节相关问题 第二节实例剖析 第三十章间接证据及网状Meta分析 第一节概述 第二节基本理论 第三节问接证据及网状Meta分析的制作 第四节实例剖析 第三十一章基因多态性研究的Meta分析 第一节基本概念 第二节Meta分析的相关问题 第三节实例剖析 第三十二章临床非随机同期对照试验的系统评价/Meta分析 第一节相关问题 第二节首次Meta分析 第三节更新系统评价/Meta分析 第三十三章其他类型的系统评价/Meta分析 第一节个体患者资料的Meta分析 第二节系统评价/Meta分析的汇总评价 第四篇Cochrane专题 第三十四章Cochrane协作网与Cochrane图书馆简介 第一节Cochrane协作网简介 第二节Cochrane图书馆简介 第三节Cochrane图书馆检索简介 第三十五章Cochrane系统评价简介 第一节概念与影响 第二节CDSR状态 第三节制作、保存、发表与更新 第四节制作步骤及结构 第五节中国作者参与发表状况调查与问题 第三十六章Cochrane系统评价的注册、完成及实例剖析 第一节CDSR的注册、撰写流程 第二节CDSR申请注册实例 第三节CDSR撰写实例剖析
作者:(美国)蔡瑞胸(Ruey S.Tsay) 译者:王远林 王辉 潘家柱
蔡瑞胸(Ruey S.Tsay),美国芝加哥大学布斯商学院经济计量学和统计学的H.G.B.Alexander讲席教授。1982年于美国威斯康星大学麦迪逊分校获得统计学博士学位。中国台湾“中央研究院”院士,美国统计协会、数理统计学会及皇家统计学会的会士,Journal of Forecasting的联合主编,Journal of Financial Econometrics的副主编。曾任美国统计学会商务与经济统计分会主席及《商务与经济统计》期刊主编。在商务和经济预测、数据分析、风险管理和过程控制领域撰写并发表了论文100多篇。他也是A Course in Time Series Analysis的合著者。 王远林,毕业于东北财经大学数学与数量经济学院,获经济学博士学位,现任东北财经大学数学与数量经济学院副教授,硕士研究生导师,主要研究方向:数理金融和金融计量经济学。 潘家柱,曾任北京大学金融数学系副教授、教授和博士生导师,并在伦敦经济学院(LSE)从事过两年的研究工作,现在英国斯特拉思克莱德大学任教。2002年,与程士宏教授等人一起获得教育部提名国家科学技术奖自然科学奖二等奖。2008年,担任第7届世界概率统计大会时间序列分组的主持人,研究工作受到英国爱丁堡皇家学会和中国国家自然科学基金委员会的基金资助。主要研究方向:时间序列分析、金融计量经济学和风险管理。 王辉,毕业于北京大学数学科学学院概率统计系,获博士学位,现任教于中央财经大学金融学院金融工程系。主要研究方向:时间序列分析和金融计量经济学。
要中,根据1968 年国际系统理论与生物学(systems theory and biology)会议(最早提出systems biology词汇[1])定义为采用系统论方法研究生物学,1989年在美国召开的生物化学系统论与生物数学国际会议探讨了生物学的系统论与计算生物学模型研究。系统理论和系统思想对于中国知识分子并不陌生,1980年代在中国学术界曾经流行过“三论”――系统论、信息论和控制论与系统科学。美籍奥地利科学家贝塔朗菲(L. Bertalanffy)在1970年代创立的“一般系统论”(general system theory),尽管贝塔朗菲是以生物学家的身份思考、研究,并不仅适用于生命科学,而且广泛应用于物理学、心理学、经济学和社会科学等各门学科;因而,过去所谈论的主要是在理论生物学层面上和普适性强的一般系统论,本文所要介绍的系统生物学(systems biology),则是生命科学研究领域的一门组学、计算和转基因系统生物技术等成熟的迅速发展学科。年贝塔郎菲多次发表系统论的文章,阐述生物学中有机体概念,提出把有机体当作一个整体或系统来研究,1950年发表生物学与物理学中的系统论和1952年发表抗体系统论[注[2]]等开创了系统生物学,第10届国际分子系统生物学会议称贝塔郎菲为第一个系统生物学家(理论层面),贝塔郎菲开创的系统生物学模型至今仍然很现代。自20世纪60年代系统生物学概念和词汇的提出和60-80年代系统生态学、系统生理学的进展,90年代系统生物医学、系统医学、系统生物工程与系统遗传学的概念发表,20世纪未细胞信号传导与基因调控的研究与系统论方法的结合,进入了分子细胞层次的系统生物学(实验与理论结合)研究与发展时期。作为人类基因组计划的发起人之一,美国科学家莱诺伊?胡德(Leroy Hood) 也是组学(omics) 生物技术开创者之一。在胡德看来,系统生物学的重新提出和人类基因组计划有着密切的关系。正是在基因组学、蛋白质组学等新型大科学发展的基础上,孕育了系统生物学的高通量生物技术和生物信息技术。反之,系统生物学的诞生进一步提升了后基因组时代的生命科学研究能力。1996年在北京举办的第 1 届国际转基因动物学术研讨会,中科院曾邦哲(曾杰)阐述了系统论与生物遗传学、转基因研究等,1999年元月于德国建立了系统生物科学与工程网(英文),表述生物系统结构论(structurity theory)的结构整合(integrative)、调适稳态(stability)与层级建构(constructive)等综合(synthetic)系统理论规律,并定义实验、计算(computational)、工程方法的生物系统分析与人工生物系统研究,同系统科学、计算机科学、纳米科学和生物医学、生物工程等领域国际科学家广泛通讯,倡导分子生物技术和计算机科学-实验生物学家与计算生物学家结合研究生物系统,唤起了一大批生物学研究领域以外的专家的关注。正如1994年曾杰(曾邦哲)“论系统生物工程范畴”等[3]表述的21世纪将进入“系统生命科学与生物工程的时代”,年系统生物学与工程(合成生物学)领域论文大量涌现。也如胡德所说,“系统生物学将是21世纪医学和生物学的核心驱动力”,基于这一信念,在系统生物学已经就要成为新的学术潮流时,1992年建立华盛顿大学分子生物技术系的胡德,在1999年年底辞去了美国西雅图市华盛顿大学的教职,与另外两名志同道合的科学家一起2000 年创立了世界上第一个系统生物学研究所 (Institute for Systems Biology)。与此同时或1999年更早的中期不少科学家开始了论述,2000年日本举办了国际系统生物学会议,2000年美国 E.Kool重新提出合成生物学-基于系统生物学的基因工程。随后,系统生物学便逐渐重新得到了生物科学界的认同。2002年03月,美国《科学》周刊登载了系统生物学专集,该专集导论中的第一句话这样写道:“如果对当前流行的、时髦的关键词进行一番分析,那么人们会发现,‘系统’高居在排行榜上。”系统生物学的基本工作流程有这样四个阶段。首先是对选定的某一生物系统的所有组分进行了解和确定,描绘出该系统的结构,包括基因相互作用网络和代谢途径,以及细胞内和细胞间的作用机理,以此构造出一个初步的系统模型。第二步是系统地改变被研究对象的内部组成成分(如基因突变)或外部生长条件,然后观测在这些情况下系统组分或结构所发生的相应变化,包括基因表达、蛋白质表达和相互作用、代谢途径等的变化,并把得到的有关信息进行整合。第三步是把通过实验得到的数据与根据模型预测的情况进行比较,并对初始模型进行修订。第四阶段是根据修正后的模型的预测或假设,设定和实施新的改变系统状态的实验,重复第二步和第三步,不断地通过实验数据对模型进行修订和精练。第一到第三阶段,也就是以下的“整合”-系统理论、“干涉”-实验生物学和“信息”-计算生物学等研究,即系统论和实验(experimental)、计算(computational)方法整合的系统生物学概念,目标就是要得到一个理想的模型,使其理论预测能够反映出生物系统的真实性。作为后基因组时代的新秀,系统生物学与基因组学、蛋白质组学等各种“组学”的不同之处在于,它是一种整合型大科学。首先,它要把系统内不同性质的构成要素 (基因、mRNA、蛋白质、生物小分子等)整合在一起进行研究。系统生物学研究所的第一篇研究论文,就是整合酵母的基因组分析和蛋白质组分析,研究酵母的代谢网络[2]。由于不同生物分子的研究难度不一样,技术发展程度不一样,目前对它们的研究水平有较大的差距。例如,基因组和基因表达方面的研究已经比较完善,而蛋白质研究就较为困难,至于涉及生物小分子的代谢组分的研究就更不成熟。因此,要真正实现这种整合还有很长的路要走。对于多细胞生物而言,系统生物学要实现从基因到细胞、到组织、到个体的各个层次的整合。《科学》周刊系统生物学专集中一篇题为“心脏的模型化――从基因到细胞、到整个器官”的论文,很好地体现了这种整合性[3]。我们知道,系统科学的核心思想是:“整体大于部分之和”;系统特性是不同组成部分、不同层次间相互作用而“涌现”的新性质;对组成部分或低层次的分析并不能真正地预测高层次的行为。如何通过研究和整合去发现和理解涌现的系统性质,是系统生物学面临的一个带根本性的挑战。系统生物学整合性的第三层含义是指研究思路和方法的整合。经典的分子生物学研究是一种垂直型的研究,即采用多种手段研究个别的基因和蛋白质。首先是在DNA水平上寻找特定的基因,然后通过基因突变、基因剔除等手段研究基因的功能;在基因研究的基础上,研究蛋白质的空间结构,蛋白质的修饰以及蛋白质间的相互作用等等。基因组学、蛋白质组学和其他各种“组学”则是水平型研究,即以单一的手段同时研究成千上万个基因或蛋白质。而系统生物学的特点,则是要把水平型研究和垂直型研究整合起来,成为一种“三维”的研究。此外,系统生物学还是典型的多学科交叉研究,它需要生命科学、信息科学、数学、计算机科学等各种学科的共同参与。系统生物学的整合性可以体现在两种不同的策略上。第一种就是切奇(Church)[4]和后来胡德(Hood)的系统生物学研究所采用的方式,选定一个较为简单的系统,如单细胞生物酵母,然后分析尽可能多的构成成分――基因组、转录组、蛋白质组、相互作用组,以揭示整个系统的行为。……
“O’Reilly Radar博客有口皆碑。”――Wired“O’Reilly凭借一系列(真希望当初我也想到了)非凡想法建立了数百万美元的业务。”――Business 2.0“O’Reilly Conference是聚集关键思想领袖的绝对典范。”――CRN“一本O’Reilly的书就代表一个有用、有前途、需要学习的主题。”――Irish Times“Tim是位特立独行的商人,他不光放眼于最长远、最广阔的视野并且切实地按照Yogi Berra的建议去做了:‘如果你在路上遇到岔路口,走小路(岔路)。’回顾过去Tim似乎每一次都选择了小路,而且有几次都是一闪即逝的机会,尽管大路也不错。”――Linux Journal
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截词检索(truncation)是指用给定的词干做检索词,查找含有该词干的全部检索词的记录,也称词干检索或字符屏蔽检索。它可以起到扩大检索范围,提高查全率,减少检索词的输入量,节省检索时间,降低检索费用等作用。检索时,若遇到名词的单复数形式,词的不同拼写法,词的前缀或后缀变化时,均可采用此方法。截词的方式有多种,按截断部位可分为右截断、左截断、中间截断、复合截断等;按截断长度可以分为有限截断和无限截断。在截词检索中,一般采用截词符号来实现检索,截词符一般为“?”或“*”。“?”一般表示1个字符,“*”一般表示0~n个字符。但不同的系统使用的截词符不同,用法也不同。 右截断:截去某个词的尾部,是词的前方一致比较,也称前方一致检索。 左截断:截去某个词的前部,是词的后方一致比较,也称后方一致检索。 中间截断:截去某个词的中间部分,是词的两边一致比较,也称两边一致检索。 复合截断:是指同时采用两种以上的截断方式。 有限截断:是指允许截去有限个字符。注意:词干后面连续的数个问号是截断符,表示允许截去字符的个数,最后一个问号是终止符,它与截断符之间要有一个空格,输入时一定要注意。 无限截断:是指允许截去的字符数量不限,也称开放式截断。上述右截断、左截断所举的例子均属此类型。 由上述可见,任何一种截词检索都隐含着布尔逻辑检索的“或”运算。采用截词检索时,既要灵活又要谨慎,截词的部位要适当,如果截得太短(输入的字符不得少于3个),将增加检索噪声,影响查准率。另外,不同的机检系统使用的截词符不同、各数据库所支持的截断类型也不同,例如DIALOG系统和STN系统用“?”、ORBIT系统用“:”、BRS系统用“$”、ESA―IRS系统用“+”等。 (五)限制检索 限制检索(range)是通过限制检索范围,达到优化检索结果的方法。 字段检索:是把检索词限定在某个/些字段中,如果记录的相应字段中含有输入的检索词则为命中记录,否则检不中。不同的系统会使用不同的检索字段符来定义字段,以用于对字段限定的表述,从而组织好表达式。不同的系统,字段符不同。 常用的检索字段符有Au=限查特定作者;JN=限查特定刊名;LA=限查特定语种:PN=限查特定专利号;PY=限查特定年代;CS=机构名称;DE=限在叙词标引中查;ID=限在自由标引词中查;TI=限在题目中查;AB=限在文摘中查找;CT=限查受控词;PA=限查专利。 字段限定检索表示检索词必须出现在指定的字段内,表述一般为以下几种形式:①字段符=检索词,主要用于中文系统;②检索词in字段符,主要用于英文系统;③检索词within字段符,主要用于英文系统;④检索词wn字段符,主要用于英文系统;⑤字段符(检索词),主要用于英文系统。
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