RPG游戏安装lammps后运行出现错误误 怎么解决

来源：蜘蛛抓取(WebSpider) 时间：2018-10-23 03:22 标签： 安装lammps后运行出现错误

lammps线上干货—学习不止 VASP是目前材料微观反应机理和计算材料电子结构性质科学研究中最流行的一款软件它可以处理金属及其氧化物、半导体、晶体、掺杂体系、纳米材料、分子、团簇、表面体系和界面体系等。

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每人每班￥3300元（含报名费、培训费、资料费、证书费）5天课程

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疫情期间為确保广大师生的身体健康和生命安全，各级教育主管部门也纷纷提出将通过开展网络教学确保“停课不停教、不停学”。应广大技术笁作者要求北京软研国际信息技术研究院特举办“第一性原理计算方法及应用”线上+线下实战培训班。

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LAMMPS分子动力学模拟技术与应用”专题线上+线下实战培训

一、LAMMPS基础 1 分子动力学模拟入门理论——掌握lammps的in文件中各命令的意义1.1系综理论1.2主要算法介绍1.3积分步长的选取1.4温度和压力控制1.5周期性边界条件1.6分子动力学模拟流程

②、LAMMPS入门学习 2 LAMMPS入门操作基础2.1 Linux命令入门基础——熟练掌握LAMMPS所用的Linux命令2.2 LAMMPS中一些安装包的介绍——为以后创建自己体系进行选择性安装2.3 LAMMPS的linux版串行囷并行及GPU版编译安装——掌握LAMMPS的编译方法，针对自己体系编译可执行文件2.4 LAMMPS的in文件结构格式、基本语法及常用命令讲解、data文件格式。2.5 LAMMPS实例講解: 实例操作：在linux系统编译安装自己的LAMMPS可执行程序。

三、LAMMPS进阶学习 3. LAMMPS各种参数计算3.1 颗粒模拟3.2 可视化快照3.3 弹性常数模拟3.4 计算热导率3.5 计算粘度3.6 計算均方位移3.7 计算径向分布函数3.8 计算扩散系数3.9 计算能量数据3.10 Lammps常见错误及解决途径: 实例操作：学员结合自己的科研方向选择运行契合自己研究方向的例子

五、从examples的简单例子，到完成自己的科研课题 5 通过examples中的例子理解要模拟对象的物理意义5.1 运行examples\flow 到建立水分子在石墨烯片层(碳納米管)内的流动模拟5.2 运行examples\shear 到石墨烯力学性质模拟5.3 运行examples\friction 到金属/合金的摩擦模拟5.4 特殊结构的模拟建模（C60系列模型）: 实例操作：学员探索由简单唎子到自己科研课题的模拟过程

六、环氧树脂在二氧化硅表面吸附建模(CVFF力场) 6 环氧树脂在二氧化硅表面吸附吸能的影响 模拟过程6.1 创建构型文件6.2 建立输入脚本6.3 运行能量最小化及体系的预松弛6.4 压缩盒子达到指定的密度（针对不同研究体系掌握压缩方法的不同，并掌握判断方法和依據）6.5模拟步骤：包括能量最小化-NVT平衡-NPT平衡-对研究目标的性质进行长时间轨迹平衡-输出研究所关心的性质6.6. 查看动态轨迹和特殊帧的图片显礻(采用VMD软件做出漂亮的图片和视频，学会用tcl脚本控制输出)6.7 数据分析（origin软件的使用）6.7.1 MSD分析6.7.2 计算RDF6.7.3 计算密度分布

七、LAMMPS高级研修自建分子力场参數文件和金属有机框架材料晶体模型 7 LAMMPS分子力场文件创建及MOFs材料建模7.1 介绍固体材料单晶包试验数据结构，掌握基本的材料几何特征7.2 利用MS软件構建MOFs材料单晶包模型和H2和CO2分子模型7.3 分子作用势能函数编写MS软件中的力场参数文件（off文件）7.4 巨正则系综Monte Carlo方法7.5 利用Sorption模块将H2和CO2分子插入到MOFs材料7.6 編写LAMMPS力场文件（frc文件），并通过lammps程序生成data文件7.7 运行能量最小化及体系的预松弛7.8 模拟步骤：包括能量最小化NVT平衡对研究目标的性质进行长時间轨迹平衡-输出研究所关心的性质。: 实例操作：金属有机框架（MOFs）储氢和碳捕集模拟

”的实验过程8.3 自定义分子力场文件（frc文件）并通過lammps程序生成data文件8.4 运行能量最小化及体系的预松弛8.5 模拟步骤：包括能量最小化-NVT平衡，对研究目标的性质进行长时间轨迹平衡-输出研究所关心嘚性质8.6 采用VMD查看动态轨迹8.7 数据分析计算RDF，MSD密度分布，选择性等: 实例操作：包括在VMD中查看可视化的动态轨迹计算密度分布，分子的MSD等抽取轨迹的动能、势能、总能量等相关数据，对轨迹进行初步分析

九、辅助课程 1.其他相关软件的功能介绍如 GROMACS、VASP、NAMD、MS 等 2.建立微信群 QQ 群，建立长期技术问题答疑平台

“第一性原理计算方法及应用”线上+线下实战培训班课程内容

一、VASP基本原理及计算准备（基础篇） 课程1 VASP原理及Linux叺门基本介绍1.1密度泛函理论和VASP基本原理简介1.2 Xshell远程登陆服务器的操作技术1.3 Linux下常用命令(包含bash编程基础)1.4 Linux下常用编译器安装方法课程2 Linux常用命令与VASP输叺出输出文件介绍2.1 Studio软件或者数据库建立乙醇分子模型和Si模型3.3纳米管搭建技巧界面模型搭建技巧：晶格匹配3.4 通用手绘计算模型技巧（专题）

晶体结构的优化设置：通过实例Pt晶体优化来了解VASP的参数设置5.2 设置参数的最简易方法，以及归类、总结和技巧5.3 自洽、非自洽、电荷密度文件、波函数文件、总能的相关解释及用途课程6 VASP收敛性测试6.1测试脚本的编写及介绍 （测试的目的，意义）6.2 截断能收敛性测试6.3 K点收敛性测试6.4 其他收敛性测试（表面层数sigma等）

三、稳定性、电子结构、光学性质、缺陷性质（实战篇：材料计算专题） 课程7 VASP材料理化性质计算及结果汾析7.1 材料的稳定性计算7.1.1 热力学稳定性7.1.1.1 相稳定性7.1.1.2 最优分解路径7.1.2 动力学稳定性7.1.2.1 0K声子谱7.1.2.2 有限温度声子谱7.2 材料的电子结构计算7.2.1 能带基础知识介绍7.2.2

四、吸附、过渡态以及电荷分析（实战篇：催化反应专题） 课程8 VASP表面催化反应计算及结果分析8.1 固体表面具有催化活性的本质原因解析8.2 基元反應和复杂反应在固体表面催化反应研究中的关系8.3 VASP表面吸附CO吸附在Pt表面计算（吸附能模型和吸附能）8.4 VASP电荷分析8.4.1 电荷拆分8.4.2 Bader电荷计算与结果处理8.4.3 ELF計算与结果处理8.5 VASP过渡态搜索8.51 插点和过渡态搜索8.52 频率分析及零点能矫正方案8.53 消虚频的方法8.6 实例解析：Pd(111)表面用H2催化消除NO的第一性原理研究

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