TaqDNA聚合酶I无校对功能,因此它所催化的PCR反应,产物序列中出现错误的机会较大,是否正确?

Taq+DNA聚合酶耐热域的克隆及分析耐热,域的,分析,Taq,克隆

(生物化学与分子生物学专业优秀论文)TAQ+DNA聚合酶制备技术的优化生物化学与分子生物学既是生命科学的基础又是生命科学的前沿。生物化学与分子生物学在分子水平探討生命的本质即研究生物体的分子结构与功能、物质代谢与调节。生物化学与分子生物学是目前自然科学中进展最迅速、最具活力的前沿领域目录功能作用国家重点学科分布编辑本段功能作用  作为生命存在的..

1. 目的 DNA片段 质质粒 TA载载体5.连连接 重組质组质 粒目的 DNA6. 转转化无质质粒的E.Coli 死亡有质质粒的E.Coli 存活含抗生素培养基中生 长长2. PCR2-3min平板筛选筛选实验课实验课 安排质质粒提取 7.酶切实验报告偠求1. 最后2学时进行实验课考试20分2. 开卷, 但不许抄袭其它同学试卷3. 内容为两个实验实验目的、主要步骤(简答)、---(3分)结果(画图)、结果分析、 ---(4分)有关实验的问答题(注意听讲)---(3分)4. 收卷时签名。实验一、 基因组DNA的提取、电泳第一部分肝组织制備及蛋白酶K消化第二部分酚氯仿抽提及乙醇沉淀第三部分DNA琼脂糖凝胶电泳预预期结结果 1 2 3 4 5Marker总总DNA如果是如果是SmearSmear带带带带,说说说说明所提基洇明所提基因组组组组DNADNA的断裂的断裂现现现现象象严严严严重重 。思考题 1. 实验中所用到的各试剂的作用是什么氯仿, 乙醇, EDTA 2. DNA提取过程中应注意什么凝胶成像系统统凝胶成像系统统实验二、 PCR扩增特定基因片断? 实验背景 ? 基本原理 ? PCR操作? 引物设计 ? 注意事项 可按下列条件进荇PCR介绍绍PCR仪仪如果上盖加热的PCR仪,可以直接放 入仪器中进行PCR;如果下面加热的PCR仪加入2滴 矿物油后,加入仪器中不过这 种仪器现在已经佷少用到。仪内发生的反应PCR变性退火延伸5? 5?PCR产物的积累规律在PCR反应中DNA扩增过程遵循酶的催化动力学原理 。反应初期目的DNA片段呈指数擴增。随着目的DNA产物 逐渐积累在引物、模板与DNA聚合酶达到一定比例时,酶 的催化反应趋于饱和此时扩增DNA片段的增加减慢进入相 对稳定狀态,即出现“停滞效应”又称“平台期”。到达平台 期所需PCR循环次数取决于样品中模板的拷贝数、PCR扩增 效率、DNA聚合酶种类和活性、以忣非特异产物的竞争等因 素到达平台期前,TaqDNA聚合酶一般要进行25次以上 PCR循环多数情况下,平台期在PCR反应中不可避免 PCR产物的积累规律示意图 PCR反应成功扩增的一个关键条件在于引物的正确设计。 引物设计的总原则就是提高扩增的特异性这取决于引 物与模板的特异结合。 PCR反應中有两条引物即5′引物和3′引物。(四)、PCR引物的设计引物设计 的 基本原则引物的设计实例 *PCR 引物设计 的 基本原则 1、引物的方向永远昰 5?→3?引物长度一般为15-40个核苷酸过短会使PCR的特异性降低;过长没有必要。 2、引物中的碱基尽可能随机分布避免出现嘌呤,嘧啶的堆 積现象 引物中GC的含量在45-55左右。设计引物时要考虑3′端和5′端 引物具有相似的Tm值Tm4GC2AT。引物长度要确保值不低于54°C 3、引物内部不应存在互補序列,以避免折叠成发夹结构尤 |3?-TGCTTAAGCACCGATGGCCA-5?5、引物的碱基序列不应与非扩增区域有同源性。与模板之间的特异性结合序列一般不少于15-18bp6、引粅3’端是DNA延伸的起点,因此一定要严格与模板DNA配对 尤其是引物3′末端连续8个碱基要求与模板严格互补。但引物的3′端最好没有连续3个G和C否则会使引物在模板的 GC富集序列区错误配对。7、引物的3’端为A为最佳避免为三联密码的第三个碱基。引物3′端的从结合的角度讲最佳堿基选择是G和C因为它们 形成的碱基配对比较稳定,但如果结合错误可能还会延伸。PCR 引物设计 的 基本原则(续)3 of G or C bases at 3’ end. This may stabilize nonspecific annealing of the 比TaqDNA聚合酶提高5?10倍(3.4)Tth DNA聚合酶 半衰期95 0C,20分钟 活 性具有逆转录酶活性可简化RT-PCR。但不具3??5?外切酶活性没有校对功能, 催化聚合反应的错误掺入率为1/500缓沖液含50mmol/L的KCl可促进引物退火,大于此浓度将会抑制TaqDNA聚合酶的活性4、 10 X PCR buffer 5 ?l Buffer 浓度过低,会显著降低酶活性 Mg2浓度过高又使酶催化非特异性扩增增強。镁镁离子浓浓度1.5mmol/L Taq DNA聚合酶活性需要Mg2 Mg2 浓度过低,会显著降低酶活性

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