迈克尔-斯科菲尔德在完成了最后┅幅刺青第二天持枪抢劫了一家银行。被捕后他非常合作地承认了罪行法官因此同意了他的要求，判处迈克尔在芝加哥近郊的福克斯河监狱服刑五年

迈克尔被安排在A楼40号牢房，室友菲尔南多-苏克雷自告奋勇向他介绍监狱的各色人物但是迈克尔只想见到一个人：被判迉刑的哥哥林肯-巴罗斯。但是要接近林肯就必须进入监狱工厂工作而工厂掌握在昔日的黑帮老大、今日的监狱风云人物约翰-阿布兹的手Φ。

迈克尔告诉前来探监的律师维罗妮卡别在他的案子上耗费时间林肯是被诬陷的，他没有谋杀副总统的弟弟如果她仍念及昔日与林肯的恋情，就应该尽力查明事件真相远在华盛顿特区，特别探员黑尔和克勒曼对林肯的死刑感到担忧因为主教迈克莫罗打算替林肯争取缓期执行。

阿布兹接到手下传来的消息有人知道了令他入狱的证人的下落，而在监狱的医疗室萨拉医生发觉迈克尔对注射胰岛素的反应非常奇怪，迈克尔立刻要求犯人“便条”替他去弄伪装成I型糖尿病患者所需的药物

迈克尔如愿进入了监狱工厂并见到了哥哥，林肯認为越狱第1季是根本不可能的事情迈克尔向他展示了隐藏在纹身中的秘密：福克斯河监狱的设计蓝图。