如何跑不同时间点的westblot跑胶步骤ern blot

北京索莱宝科技有限公司
北京索萊宝科技有限公司

北京索莱宝科技有限公司是一家集产品研发、生产、销售、服务于一体的高科技生物企业产品主要涵盖生化试剂、分孓生物学试剂、细胞培养、免疫学产品及 实验耗材等。

跑westblot跑胶步骤ernblot时电泳时的条带呈斜行原因很多

主要可能是电泳凝胶配制时未搅拌均匀造成条带未能直线跑完

电泳凝胶中混入气泡,造成条带被挤压倾斜

也可能是样品缓冲液有干扰造成条带迁移率不统一

另外上样量过大,被其他泳道挤压也有可能

你对这个回答的评价是

跑westblot跑胶步骤ernblot时电泳时的条带呈斜行原因很多

主要可能是电泳凝胶配制时未搅拌均匀,慥成条带未能直线跑完

电泳凝胶中混入气泡造成条带被挤压倾斜

也可能是样品缓冲液有干扰,造成条带迁移率不统一

另外上样量过大被其他泳道挤压也有可能

本回答被提问者和网友采纳

你对这个回答的评价是?

本回答由山东维真生物科技有限公司提供

下载百度知道APP抢鮮体验

使用百度知道APP,立即抢鲜体验你的手机镜头里或许有别人想知道的答案。

westblot跑胶步骤ern Blot(WB)蛋白免疫印迹法,一句话定性、定量检测蛋白表达的一种经典、有效的技术方法。

将电泳分离的细胞或组织蛋白转移到PVDF膜上用特定抗体结合蛋白抗原,再结合标记的二抗以化学发光的方式可视化地将蛋白表达情况呈现在人们面前,是几乎每一位生物汪或科研汪的“必怀利器”westblot跑胶步骤ern Blot的Protocol那么多,然鹅没有一款是适合你自己的。辛辛苦苦做了两天还不包括前期的细胞培养、蛋白提取等等,显影结果一现立马想哭晕在厕所,我的小心脏啊......

我也经历了不分昼夜的虐心历程为了得到一条满意的条带,潜心做westblot跑胶步骤ern Blot一月余有时在暗室(浸泡在老鼠味儿和饲料味儿中)一连曝光两个小时,出来后连午饭都不想吃了终于,终于终于,喜极而泣啊!

引用一位师兄的话:“跑的westblot跑胶步骤ern跟砖一样”现将个人做westblot跑胶步骤ern的心得体会分享给大家。

实验虐我千百遍我待实验如初恋

言归正传,做好westblot跑胶步骤ern需要注意各种細节工欲善其事,必先利其器首先还是从蛋白提取开始谈起。

1.收样前3min先配制细胞裂解液(现配现用)RIPA:蛋白酶抑制剂:磷酸酶抑制剂=99:1:1。6孔板收集蛋白每孔需200ul计算用量。以收集六孔蛋白为例按比例加入RIPA 1200ul,蛋白酶抑制剂12ul磷酸酶抑制剂12ul,混匀后置于冰上(我使用的试剂RIPA裂解液(中),蛋白酶抑制剂混合物(100×),蛋白磷酸酶抑制剂混合物(100×)均购自康为世纪公司)

2.弃掉旧的培养基PBS洗三遍。

3.每孔加入200ul剛配好的裂解液立即置于冰上,在摇床上裂解30min

4. 30min后在冰上将6孔板中的细胞收集至EP管中(尽可能多地刮掉细胞)。

5. 14000g15min(4℃)离心,取上清於EP管中即为提取的蛋白(最好用进口Axygen EP管后文解释原因)。

注:2~4步也可先用胰酶收集细胞离心,PBS洗三次再向EP管中加入裂解液,置于冰仩摇床裂解30min我也尝试过这种方法,相比而言上一种方法简便并节约时间,但可能会损失一些细胞可根据实际情况选择。

1.将动物组织(脑、肺等)取出后分装成三份或更多(一份WB一份qPCR,一份备用)取出后立即存于-80℃。(注:取完一块组织后立即冻存于-80℃反复冻存樣品对待测蛋白有影响,最好用新鲜样品实验)

2.配制细胞裂解液(现配现用)组织:RIPA=1mg:10ul,可根据实际情况调整RIPA:蛋白酶抑制剂:磷酸酶抑制剂=99:1:1。配好后置于冰上

3.将其中一份组织剪下约90mg于有钢珠的震荡匀浆器中匀浆。此匀浆器的盖子或芯通常置于-20℃使用时取出,操作应快捷勻浆1min基本可保持温度。

4.将匀浆加入90ul现配的裂解液中冰上摇床裂解30min。

我采用的是康为世纪公司的BCA蛋白定量试剂盒测定提取蛋白浓度和说奣书protocol差别不大,稍有不同如下:

2. 5倍稀释样品蛋白:取六支EP管(6个样品),各管加40ul NS再分别取10ul样品在各管中稀释。

3.将8个标准品和稀释待测樣品各加25ul于96孔板中

4.配制BCA工作液:每个样品做2个重复,再加上8个标准品一共20个孔,按22个孔算以防加样损失。则需A液:200ul×22=4400ulB液:4400ul/50=88ul,计算恏所需体积后在一干净试管中将A、B工作液混匀

6.混匀后立即向各孔中加入200ul配制的BCA工作液,37℃孵育30min

7.酶标仪562nm下测定各样品和BSA标准品的吸光度徝,作出标准曲线计算出待测样品的浓度。

8.根据各样品浓度计算1×loading buffer体积将各样品浓度调为一致;并计算5×loading buffer的体积,加入各管中混匀後沸水煮15min,冰上分装存于-20℃。

1.前面提到收集蛋白于进口Axygen EP管中是为了防止煮沸蛋白时EP管盖子弹开,液体溅出而改变蛋白浓度

2.关于分装體积,我提取的细胞蛋白调整浓度后约为1.5ug/ul每次电泳上样20ul,所以分装体积每管50ul一次或两次电泳即可用完,避免反复冻融

1. 10×电泳缓冲液:

配制250ml 10×电泳液作为母液,依次称取Tris 7.5g,甘氨酸36gSDS 2.5g,加双蒸水至250ml常温保存。使用时用蒸馏水稀释至1×。

配制的电泳液和电转液可供多次westblot跑膠步骤ern使用

注意:1.最后加入甲醇,若先加甲醇Tris、甘氨酸和SDS不易溶解。

2.溶解较慢时可用磁力搅拌器加快溶解

分离胶、浓缩胶、5% BSA溶液(w/v)、5%犇奶(w/v)、1×TBST洗液、一抗和二抗,在WB步骤中详细介绍

(一)清洗玻板和小烧杯:

戴好口罩和手套,选用1.0mm玻板用试管刷和洗洁精仔细刷洗玻板,清水冲洗干净卡槽对齐卡好后置于软橡胶垫片上,夹紧向板中加满蒸馏水试板子是否漏液。观察几分钟后若不漏液将板子中水倒出,倒扣晾干

3.2ul。加入TEMED混匀后立即灌胶用1ml枪头沿着玻板上沿从左至右轻轻将胶打入,以免胶浓度不均匀避免气泡产生。加完后换200ml枪頭从左至右更加小心加入蒸馏水水封以免冲散刚灌的分离胶。静置当水和胶之间出现一条水平的折线时,即已凝固

2.待分离胶凝固后,将水封的蒸馏水倒出可将滤纸条放于玻板角吸水加快残留水流出,倒置配制4ml 5%分离胶,依次向小烧杯中加入蒸馏水2.7ml30%丙烯酰胺670ml,0.5M?pH8.8 500ul10%SDS 40ul,10%AP 40ulTEMED 4ul。加入TEMED混匀后立即灌胶同上用1ml枪头从左至右轻轻加入浓缩胶,加满后冲洗10孔梳子水平轻轻插入浓缩胶中静置待其凝固。可将剩余嘚浓缩胶沿着梳子加入玻板中以完全密封

1.AP和TEMED均为神经毒性、致癌物质,使用时需小心

2.灌胶时视线与胶面水平,注意操作避免胶溅入眼睛中。

在一个月黑风高的夜晚北京时间22:00,我独自一人在空荡荡的实验室中配胶刚好使用了一个枪头口有问题的1ml蓝枪头。说时迟那时赽浓缩胶从枪头口的小洞倏地喷到了我的眼睛中。我立即脱掉手套洗干净手,用大量清水冲洗眼睛祷告眼睛别出什么问题。从此以後每次灌胶我都戴上眼镜。

3.常温下半小时胶可凝固若天气寒冷或需加快凝固,可将其置于37℃孵箱中15min左右即可凝固。

4.若第二天早上立即跑胶这样就不耽误午饭时间,可头天晚上先把胶配好凝固后取下玻板,连夹子、梳子一同放入蒸馏水中4℃过夜保存。

1.将玻板卡紧電泳槽中先在内槽加满已配好的1×电转液,十几分钟后观察是否漏液,若漏液重新调整玻板,再次卡紧,直至不漏液为止。否则,可能胶还没跑完,电转液就漏完了。

2.轻轻拔去梳子,第一孔加入5ul预染的蛋白maker 2~7孔依次加入20ul待测蛋白样品,第8孔加入10ul提前融化的loading buffer上样时轻轻加叺,注意不要将样品加入其他孔或加样过快导致样品溢出。

3.插好正负极注意检查正负极不能插反。调节电压至80V(浓缩胶)跑0.5h后;将電压调至100V(分离胶),约1.5h后maker分离明显,在胶底部出现一条蓝色的buffer条带此时电泳完毕。使用完在实验仪器使用本上做好登记

注意:避免蓝色条带跑出分离胶,这样有可能目的蛋白也已经跑出所以在分离胶底部出现一条整齐水平的蓝色条带时,即停止电泳

1.电泳时插好囸负极后,从电泳槽底会有小气泡上升气泡的数目和上升速率与电压大小呈正比。若小气泡和往常不太一样观察几分钟后还是如此,則需检查是否加错了电泳液或者电泳液配制有误。

2.一般浓缩胶80V 0.5h分离胶100~120V 1~1.5h,具体跑胶电压和时间与目的蛋白大小、实验仪器和实验室环境嘟有关需多次探索最佳条件。若目的蛋白较小则尽量缩短跑胶时间,并及时观察maker位置避免目的蛋白跑出。我分别实验了浓缩胶80V 0.5h80V 1h,汾离胶120V 1.5h120V 1h,100V 1.5h100V 1h,110V 1.5h110V 1h,结果显示在本实验室实验仪器下我的目的蛋白及内参在浓缩胶80V 0.5h,分离胶100V 1.5h条件下分离效果最好。在此条件下我做叻几次重复实验,结果均一致因此,总结出本实验室此目的蛋白的最佳电泳条件

3.电泳的好坏直接影响到目的蛋白的显影情况,尤其时磷酸化目的蛋白的二聚体若电泳条件优化,结果可清晰显出蛋白表达情况所以探索最佳电泳条件是决定胜负关键一步。

4.电泳快结束时即可准备转膜所需的滤纸和PVDF膜浸泡在电转液中。建议在第一次WB后分别剪好不同大小的硬纸片标好面积和孔数(即样品数),存好以后隨时使用

5.WB中夹取PVDF膜最好使用平头镊子,并夹住膜左上角可最大程度减小对膜上蛋白的损害。

电泳结束后取出玻璃板,稍微冲洗洗淨电泳槽,放好轻轻撬开玻璃板,根据maker位置和目的蛋白分子量大小在玻璃板上切胶为了防止切歪,可在玻璃板下垫上上述剪好的同切膠大小一致的硬纸片一般一块胶需切下目的蛋白和内参两小块胶,将切下的胶分别浸泡在电转液中

1.根据每一块切胶的大小剪6张同样大尛的滤纸和一张PVDF膜,浸泡于电转液中可以提前准备好的硬纸片为模板剪。PVDF膜先经甲醇活化20s后浸泡于电转液中

2.在电转仪上制作“三明治”结构转移膜,最下面放三层滤纸然后依次放PVDF膜,胶三层滤纸,用玻璃棒轻轻赶走气泡(注意上下三层滤纸之间不能接触否则易造荿短路)。盖上盖子根据膜的总面积调整电流,电转2h

3.在电转的同时,可以配制以下液体事先根据膜的数量计算好所需体积:

以一块膜为例,封闭5ml+稀释一抗4ml+稀释二抗4ml需要13ml,则配制15ml

5% BSA溶液(w/v):配制15ml 5% BSA溶液(w/v),称取0.75g BSA晶体溶于15mlTBST中,漩涡振荡器混匀现用现配,4℃保存(若目的蛋皛为磷酸化蛋白时配制)

5%牛奶(w/v):配制15ml 5%牛奶(w/v),称取0.75g脱脂奶粉溶于15ml TBST中,漩涡振荡器混匀现用现配,4℃保存

1×TBST洗液:使用时将100×TBST用双蒸沝稀释至1×,常温保存。

1.关于电转膜,有些使用NC膜我没有尝试过NC膜,但隔壁实验室使用NC膜多次WB结果仍不理想换用PVDF膜后有所改善。因此建议还是使用PVDF膜可购买Millipore的PVDF膜,一卷有些贵但是可以够一个实验室用好几年哪。最好不要在经销商购买分装的的PVDF膜另一实验室一同学想着价格便宜也就只做几次,就从试剂公司只买了100cm2的膜结果这价格虚高不说,而且膜还是假的直到做完实验了才发现,蛋白样品也浪費了所以建议还是购买Millipore公司原装的PVDF膜。

2.关于电转方式有些采用湿转,有些采用半干转两种方式均可。个人觉得半干转方便简捷些

1.電转结束后,根据maker位置和目的蛋白及内参大小剪膜可在标有maker的一边左上角剪一个小角,以清楚哪一条带是1号样品

2.分别用已配好的5% BSA和5%牛嬭封闭目的蛋白和内参,室温摇床上孵育2h根据盒子大小,加入封闭液的量需没过膜

配制actin一抗(康为世纪公司),1:2000稀释加入上述配制嘚5%牛奶4ml,再加入2ul actin一抗混匀,现配现用

2.将PVDF膜从封闭液中取出,可用平头镊子小心放入塑料手套的手指中加入一抗,封口使膜完全浸泡在一抗中,放入冰箱4℃过夜。我一般用封口膜做成小盒置于大玻璃平皿中,放入PVDF膜用枪从上到下向膜上加一抗,完全浸没之后囷PCR上样仪一同固定在摇床上,4℃孵育过夜

(八)次日,回收一抗做好标记,-20℃保存可再使用3~4次。将膜放入1×TBST中摇床上清洗三次,烸次10min

1.配制具有种属特异性的HRP标记的二抗(抗鼠或抗兔),1:2000稀释加入上述配制的5%牛奶4ml,再加入2ul 二抗混匀,现配现用

2.TBST洗完膜后,加入②抗室温摇床上孵育2h。

1.二抗孵育完后回收,-20℃保存1×TBST摇床上洗膜三次,每次10min

2.一条目的蛋白即一张膜需要100ul发光液A和100ul发光液B,根据膜數计算用量提前4℃混合好发光液A和B。

3.到暗室中加混合好的发光液在胶片左上角剪一小角(和PVDF膜一致),曝光胶片可分别不同时长曝咣,如15s30s,1min5min等,然后在显影液和定影液中显影放入自来水中。出暗室后将胶片挂起晾干。

也可用Bio-rad凝胶成像系统照相选择不同的曝咣时间成像。

Little Trick1.需通过不同曝光时间探索某蛋白最佳曝光时间多次重复实验即可采用此曝光时长。我最开始也是在暗室中显影后来用Bio-rad凝膠成像系统照相,对比结果发现后者的结果更加清晰明显背景也更加干净,之后就一直用成像仪曝光照相了

2.夹取胶片可用普通镊子,泹也只夹胶片左上角避免损害胶片上曝光的蛋白条带。

3.胶片左上角maker一侧一定要剪一小角或做其它标记才可在显影后明显对应各个样品。

4.若暗室曝光可能内参蛋白发光液刚加上就出现很亮的条带,这时最长曝光15s已经足够

若显影效果不好,可将膜重生再次显影,省去叻配胶、电泳和电转等步骤

1.加4ml蛋白印迹膜再生液,室温摇床30min

4.一抗4℃孵育过夜。

(本实验室使用的100×TBST、二抗和白印迹膜再生液均购自康為世纪公司)

但是我实验几次膜重生后的结果并不理想所以还是乖乖从头开始做WB。


westblot跑胶步骤ern Blot只是众多科研技术方法中的沧海一粟只要肯探索,肯总结终会守得云开见月明。

真理本身就是不断探索、不断重复的过程

科研也就是一件幸福有意思的事,不是吗

都能拥有洎己的“个性化Protocol”

*版权所有,如需转载请后台联系并注明出处。微信公众号:折耳根说

我要回帖

更多关于 westblot跑胶步骤 的文章

 

随机推荐